在公司债券内部交易以后的会计期间，企业债券交易规则对以前期间发生的内部交易公司债券，由于发行公司债券的企业在以前期间因发行该公司债券计算确认的实际利息费用（财务费用），在其个别财务报表中通过减少当期未分配利润递延至本期期初，成为本期期初未分配利润减少的一部分；而购买公司债券的企业债券因持有该内部公司债券在以前期间计算确认的投资收益，在其个别财务报表中也递延至本期期初，成为本期期初未分配利润的一部分。因此企业债券在发生公司债券内部交易以后的会计期间编制合并财务报表时，首先，应当根据以前年度累计抵销的实际利息费用（财务费用）和投资收益的金额，调整期初未分配利润的金额。其次，企业债券应当将应付债券与债权投资项目的金额予以抵销。再次，对于分期付息、到期一次还本的公司债券，还应当将应付利息与应收利息的金额予以抵销。最后，还应当将当期因该内部交易公司债券计算确认的实际利息费用（财务费用）与债权投资计算确认的投资收益予以抵销。

在按照以前期间因该公司债券内部交易相关的实际利息费用（财务费用）和投资收益的抵销而对本期期初未分配利润的累计影响予以抵销时，必须将以前企业债券期间涉及实际利息费用（财务费用）和投资收益的抵销金额对本期期初未分配利润的累计影响全部予以抵销。抵销处理后，本期合并工作底稿中计算的期初未分配利润的合并数与上期合并财务报表中期末未分配利润的金额一致。也可以这样理解，即将以前期间编制合并财务报表时涉及利润表的抵销项目，转换为“年初未分配利润”项目，在本期编制合并财务报表时重新进行一次抵销处理。应付债券与债权投资项目的抵销，由于发行企业的应付债券与购买企业债权投资账面价值之间存在差异，在对其进行合并抵销处理时，应当将其差额转作财务费用处理，按企业债券应付债券的金额，借记“应付债券”项目，按债权投资的金额，贷记“债权投资”项目交易规则，按两者之间的差额，借记或贷记“财务费用”项目。对于应付利息和应收利息由于均是按面值和票面利率计算的，不存在差异，在合并抵销处理时没有特殊之处。进行合并抵销处理时，按公司债券面值和票面利率计算的应收、应付利息的金额，借记“应付利息”项目，贷记“应收利息”项目。