在新三板成为资本市场瞩目的新星以后，资本市场效率理论全国中小企业股份转让系统有限责任公司正式在国家工商总局注册登记。该资本市场公司于2013年1月16日正式揭牌运营——这是资本市场中国场外市场建设的标志性事件，同时也是全国场外市场从试点走向规范性运作的重要转折点。

  从此，新三板正式由长长的学名变更为“全国中小企业股份转让系统”（下简称“股份转让系统”）全国性场外市场的运作管理机构也从原来的中国证券业协会变为系统公司，资本市场先前在新三板挂牌的公司也全部由系统公司承接。与此同时，国务院也加快了新三板试点迈向全国扩容的步伐。2013年12月14日发布的《国务院关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》，资本市场标志着新三板从试点阶段正式进入全国扩容实施阶段。同年12月31日，股份转让系统正式面向全国受理企业挂牌申请。这表明，全国股份转让系统正式结束了在国家高新园区内的小规模、区域性试点，资本市场业务范围覆盖全国，已进入实质性操作阶段。

  新三板面向全国受理挂牌申请后，在短短一个多月的时间内，挂牌企业实现了井喷式的发展。2014年1月24日，股份转让系统首批全国企业集体挂牌仪式在京举行。资本市场这是《国务院关于全国中小股份转让系统有关问题的决定》之后，全国股份转让系统举办的首场集体挂牌仪式，而资本市场该挂牌仪式的广受瞩目，也标志着未来新三板10～15年蓬勃发展的春天真正拉开序幕。